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玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 练冬梅 1 ; 赖正锋 1 ; 姚运法 1 ; 张少平 1 ; 林碧珍 1 ; 洪建基 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院亚热带农业研究所

关键词: 玫瑰茄;花瓣;花萼;转录组;花青素;差异表达基因

期刊名称: 江苏农业科学

ISSN: 1002-1302

年卷期: 2020 年 006 期

页码: 41-45

收录情况: 北大核心

摘要: 以玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa Linnaeus)花瓣和花萼为研究对象,采用Illumina HiseqTM 2500高通量测序技术,对花瓣和花萼进行转录组测序及花青素合成相关基因差异表达分析.结果表明,花瓣和花萼共获得13.94 Gb有效数据(clean data),Q30碱基百分比均达到93.0%以上;共获得1 399个差异表达基因(DEGs),包括65个上调基因,1 334个下调基因,且功能注释的基因有1 176个;筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、FLS、ANR、CHI在花萼中表达显著,FLS、ANR在花瓣中表达显著.本研究丰富了花青素相关研究,可为阐明玫瑰茄花青素合成机制提供理论依据.

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