文献类型： 中文期刊

作者： 宋敏 ¹ ; 马芳芳 ¹ ; 侯思宇 ¹ ; 张雁明 ¹ ; 刘龙龙 ² ; 耿潞阳 ¹ ; 江璇宇 ¹ ; 李红英 ¹ ; 韩渊怀 ¹ ;

作者机构： 1.山西农业大学

2.特色杂粮种质资源发掘与育种改良山西省重点实验室

关键词： 谷子;泛素连接酶E3;干旱胁迫;表达谱

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2016 年 36 卷 12 期

页码： 860-867

摘要： [目的]探析谷子调控干旱胁迫的E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在PEG胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件MBS或脱落酸响应元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m与PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m与PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶E3基因提供理论依据。