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基于SSR标记的山西省不同地区苦荞遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 马名川 1 ; 张丽君 1 ; 刘璋 1 ; 刘龙龙 1 ;

作者机构: 1.山西农业大学农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室

关键词: 苦荞;SSR;遗传多样性;遗传结构分析

期刊名称: 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-8151

年卷期: 2021 年 41 卷 003 期

页码: 25-31

收录情况: 北大核心

摘要: [目的]阐明山西省苦荞种质资源遗传多样性和遗传结构,为苦荞种质资源的保护与高效利用提供理论依据.[方法]利用13对荧光SSR引物对来自山西省不同地区的49份苦荞资源DNA进行PCR扩增,扩增产物经毛细管电泳,得到片段大小.利用Powermarker 3.25软件进行遗传多样性分析,用MEGA 6.0软件构建UPGMA聚类图,采用Structure2.3.1软件进行群体遗传结构分析.[结果]13对引物对49份山西苦荞资源扩增出等位变异42个,变化范围2~5个,平均3.2个;等位基因频率的变化范围为0.3367~0.9388,平均为0.6491,基因多样性指数变化范围为0.1166~0.7199,平均为0.4475,多态信息含量的变化范围为0.1129~0.6686,平均为0.3869.全部材料聚类分析表明,49份材料被分为2个类群;按地区来源划分成的9个群组进行聚类分析,结果表明资源的地理来源地有较为明显的分化.群体结构分析将参试材料划分为5个类群.[结论]山西省苦荞种质资源多样性水平中等,有4份苦荞资源与其他资源遗传距离较远.

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