文献类型： 中文期刊

作者： 李俊茹 ¹ ; 马晓 ¹ ; 吴利敏 ¹ ; 刘慧芬 ¹ ; 石西 ¹ ; 宋红梅 ² ; 田雪 ¹ ; 李学军 ¹ ;

作者机构： 1.河南师范大学水产学院河南省水产动物养殖工程技术研究中心

2.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部休闲渔业重点实验室

关键词： 锦鲤;miRNA-137;进化;表达;靶基因;体色

期刊名称： 水产学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 831-845

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究microRNA-137（miR-137）与锦鲤体色形成的关系,实验对已报道的14种鱼类miR-137前体序列（precursor miR-137, pre-miR-137）进行比对,利用最大似然估计法（Maximum Likelihood Estimate, MLE）构建系统进化树,同时荧光定量PCR （quantitative realtime PCR, qRT-PCR）分析其在体色发生阶段和不同组织中的相对表达水平,并预测其靶基因,随后对靶基因进行GO和KEGG分析,最后通过荧光素酶实验验证miR-137-3p与靶基因的靶向关系,并分析miR-137-3p与靶基因mRNA的表达变化。结果显示,锦鲤与鲤的pre-miR-137序列相似度最高,且pre-miR-137序列在所有鱼类中具有较高的保守性。对miR-137靶基因进行GO和KEGG分析,多个靶基因富集在色素沉积、色素细胞分化等信号通路。定量结果显示,锦鲤出膜后11 d（day post hatching, dph） miR-137-3p表达量达到最高,随后显著降低;miR-137-3p在锦鲤不同组织中均有表达,在眼和肌肉中表达量较高,在皮肤和鳍条等色素细胞存在的组织中也有较高表达,且白色组织表达量显著高于红色组织。荧光素酶实验结果显示,miR-137-3p可结合在mitfa 3′-UTR上并抑制其表达,但对sprb并无显著抑制作用;miR-137-3p与mitfa和sprb在不同发育阶段存在显著负相关,但在组织中不存在相关性。本研究发现,miR-137在鱼类进化过程中高度保守,与锦鲤体色形成具有一定的相关性,且可靶向调控mitfa参与体色的形成,以上结果为进一步探讨miR-137在锦鲤体色形成中的作用提供基础数据。