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基于KASP标记的285份辣椒种质资源多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 宋拉拉 1 ; 朱文超 2 ; 白立伟 2 ; 苏丹 2 ; 彭泽 2 ; 廖芳芳 2 ; 胡明文 2 ;

作者机构: 1.贵州省辣椒研究所

2.贵州省蚕业研究所

关键词: 辣椒;KASP-SNP标记;种质资源;等位基因;遗传多样性;多态性

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2025 年 53 卷 008 期

页码: 19-30

收录情况: 北大核心

摘要: [目的]探明辣椒种质资源遗传多样性,为筛选优良的辣椒核心种质资源和辣椒品种选育提供理论依据.[方法]以 285份辣椒种质为材料,选用 89对KASP-SNP分子标记,用竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记对辣椒种质资源进行多态性分析.[结果]用 89对KASP-SNP分子标记筛选出 64个多态性较高的单核苷酸多态性标记(SNP),共检测到 128个等位基因,主要等位基因频率为 0.501 8~0.970 1,平均值 0.7296;多态性信息值(PIC)为 0.0563~0.3749,平均值 0.2815,表明 285份辣椒种质具有中等遗传多样性.通过UPGMA聚类分析可将 285份辣椒种质分为 3个类群,各类群在果实形态、颜色和植株特性上差异明显,聚类结果与表型特征一致.群体结构分析表明,74.04%的材料遗传背景简单(Q≥0.60),适合稳定育种;25.96%的材料遗传背景复杂,具有较大潜力用于杂交育种,以扩展遗传基础.[结论]285份辣椒种质具有丰富的遗传多样性,采用KASP技术可有效鉴定辣椒种质资源在基因组水平的遗传关系和结构特征,有助于提高亲本选择利用率和育种进程.

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