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水稻黑条矮缩病毒基因组片段S10的cDNA克隆及全序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张恒木 1 ; 陈剑平 2 ; 薛庆中 1 ; 雷娟利 2 ;

作者机构： 1.浙江大学农业与生物技术学院

2.浙江省农业科学院病毒学实验室

关键词： 水稻黑条矮缩病毒;基因组片段;序列分析

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2002 年 16 卷 01 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 基于 RT- PCR策略克隆了水稻黑条矮缩病毒 (rice black- streaked dwarf virus,RBSDV)浙江分离株基因组 S10 ,并测定了它的全序列。结果表明 ,水稻黑条矮缩病毒浙江分离物 (RBSDV- Zj)基因组片段 S10全长 180 1nt(EMBL登录号为AJ2 97433) ,仅含有一个大的开放阅读框 (open reading frame,ORF) ,编码一个 6 3.1k D的多肽 ,与日本的水稻黑条矮缩病毒基因组片段 S10在核苷酸和氨基酸水平上同源性分别为 93.8%和 96 .2 %;与意大利玉米粗缩病毒 (maize rough dwarfvirus,MRDV)的基因组片段 S10在核苷酸和氨基酸水平上的同源性分别为 87.7%和 92 .0 %,推测它们是同一病毒的不同地理小种。

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