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DNA条形码在篮子鱼科鱼类种类鉴定和系统进化分析中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 闫亚利 1 ; 张楠 1 ; 郭华阳 1 ; 郭梁 1 ; 朱克诚 1 ; 刘宝锁 1 ; 张殿昌 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;广东省海洋生物种业工程技术研究中心

关键词: 篮子鱼科;COⅠ基因;DNA条形码

期刊名称: 南方水产科学

ISSN: 2095-0780

年卷期: 2019 年 01 期

页码: 100-105

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立篮子鱼科鱼类物种快速鉴定方法,该研究扩增获得了篮子鱼科10种鱼类的46条线粒体COⅠ基因序列,结合从BOLD和GenBank上筛选出的12种27条篮子鱼科COⅠ基因序列,分析篮子鱼科鱼类的COⅠ基因片段序列特征、种间和种内遗传距离及分子系统进化关系。结果表明,19种73条篮子鱼科COⅠ基因序列的平均碱基组成为T:28.9%、C:28.7%、A:24.6%、G:17.8%。G+C的含量(46.5%)低于A+T的含量(53.5%),碱基组成表现出明显的偏倚性;篮子鱼科鱼类的种间平均遗传距离为0.098,是种内平均遗传距离(0.002)的49倍;基于19种篮子鱼科鱼类的COⅠ序列的系统进化分析结果显示,19种篮子鱼中仅单斑篮子鱼(Siganus unimaculatus)和狐篮子鱼(S. vulpinus)聚类在一起,形成1个分支,剩余17种(89.5%)篮子鱼相同种内个体各自聚为一支,形成17个独立的分支。结果表明基于COⅠ基因的DNA条形码技术可应用于篮子鱼科物种鉴定。

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