文献类型： 中文期刊
作者：
张成玲
1
;
孙厚俊
1
;
杨冬静
1
;
徐振
1
;
赵永强
1
;
谢逸萍
1
;
作者机构： 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
关键词： 甘薯双生病毒;外壳蛋白基因;分子变异;遗传多样性
期刊名称： 浙江农业学报
ISSN： 1004-1524
年卷期： 2017 年 29 卷 04 期
页码： 611-617
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 甘薯双生病毒是中国甘薯上一类重要病毒,其外壳蛋白(coat protein,CP)基因具有介体传毒、基因包被等多功能。揭示其分子变异,可以为病毒防治及育种工作提供理论依据。利用PCR方法扩增获得了24个甘薯双生病毒分离物的cp基因,采用SDT、Dna SP、RDP3、MEGA等软件对其进行分子变异分析。结果表明:24个分离物核苷酸序列均为765个碱基,一致率为88.3%~100%,编码254个氨基酸,一致率为94.5%~100%。中国甘薯双生病毒分离物系统进化树分为2个组,组I包括大部分分离物及本研究获得的22个分离物,又分为了2个亚组;组Ⅱ含有29个分离物,包括本研究中的XU8_2和XU8_3,这2个分离物与其他分离物可能为不同的种。非同义突变与同义突变比值大于1,说明cp基因处于正向选择即多样化选择。错配分布图除亚组1相对比较平滑外,其余组或亚组分离物均为多峰锯齿状,表明除亚组1种群呈突然暴发的状态外,其他组或亚种群已经存在很长时间,处于动态平衡状态。
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