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藏红花酸糖基转移酶UGTCs4基因的克隆、生物信息学及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赖成霞 1 ; 玛依拉·玉素音 1 ; 高燕 1 ; 李春平 1 ; 刘忠山 1 ; 石必显 1 ; 王博 1 ; 王玮 1 ;

作者机构: 1.新疆农业科学院经济作物研究所;新疆农业科学院微生物应用研究所

关键词: 藏红花酸;糖基转移酶;克隆;表达分析;藏红花悬浮细胞

期刊名称: 中草药

ISSN: 0253-2670

年卷期: 2020 年 04 期

页码: 1044-1051

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的以藏红花悬浮细胞为研究对象,克隆藏红花酸糖基转移酶(crocetin glycosyltransferase)UGTCs4基因,并对其进行生物信息学和表达分析。方法采用同源克隆法和5’RACE(rapid amplification of c DNA ends)技术克隆UGTCs4基因的全长c DNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测其编码蛋白的结构与功能,并通过半定量RT-PCR(semi-quantitativereversetranscriptionandpolymeraseChainreaction)方法检测不同诱导物条件下的基因表达情况。结果 UGTCs4基因的c DNA全长为1 380 bp,编码459个氨基酸。分子进化树分析,该糖基转移酶基因与已知的藏红花酸糖基转移酶基因UGTCs2具有相同的糖基化藏红花酸的功能。RT-PCR的结果显示,UGTCs4基因能够响应吲哚乙酸(IAA)、脱落酸(ABA)、赤霉素(GA)、过氧化氢(H2O2)、茉莉酸甲酯(Me JA)多种处理,这些处理均能促使其进行转录。结论首次从藏红花悬浮细胞中分离并报道了UGTCs4的c DNA克隆,并证实UGTCs4对不同诱导子的响应情况,为进一步研究藏红花素的生物合成及表达调控研究奠定了基础。

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