文献类型： 中文期刊

作者： 顾丽红 ¹ ; 刘志勇 ¹ ; 张细权 ¹ ; 邱峰芳 ¹ ; 邢增杨 ¹ ; 赵建国 ¹ ; 林哲敏 ¹ ;

作者机构： 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所;海南大学热带农林学院;华南农业大学;东华理工大学;文昌龙泉文昌鸡实业有限公司

关键词： 文昌鸡;RNA测序;可变剪接;单核苷酸多态性;新转录本

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2019 年 03 期

页码： 7-15

收录情况： 北大核心

摘要： 采用生物信息学的方法对180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡RNA-Seq的94 614 632的Clean Reads进行了单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到可靠的SNP位点220 308个,可变剪接56 119个,优化了21 633个基因,预测到1 235个新转录本。本研究结果能够进一步完善鸡基因组注释情况并丰富鸡SNP数据库和可变剪切数据库。