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草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析

文献类型： 中文期刊

作者： 汪虹 1 ; 陈明杰 1 ; 冯爱萍 1 ; 谭琦 1 ; 鲍大鹏 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心国家食用菌加工技术研发分中心上海市农业遗传育种重点开放实验室

关键词： 草菇;A交配型基因;同源异形结构域蛋白

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2015 年 22 卷 01 期

页码： 1-7

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,长度分别为1341bp和1450bp,各编码446和429个氨基酸残基;A2位点的交配型基因为HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,长度分别为1442bp和1501bp,各编码463和443个氨基酸残基。利用生物信息学方法分析了泰国1号及另外两株草菇代表性菌株V23和屏优的交配型基因编码的HD蛋白序列,结果表明:HD蛋白均含有同源异形结构域。根据系统进化树可以看出,泰国1号与V23、屏优菌株A位点HD1和HD2基因序列所编码的氨基酸序列之间亲缘关系复杂,可能具有不同的起源。

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