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副猪嗜血杆菌中毒素蛋白基因hipA的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 车勇良 1 ; 陈如敬 1 ; 王隆柏 1 ; 吴学敏 1 ; 刘玉涛 1 ; 王晨燕 1 ; 周伦江 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

关键词： 副猪嗜血杆菌;毒素蛋白;HipA蛋白;生物信息学

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2016 年 32 卷 02 期

页码： 1-4

收录情况： CSCD

摘要： 为预测毒素蛋白HipA的二级结构和B细胞抗原表位,首先从GenBank中查找副猪嗜血杆菌毒素蛋白基因hip A的序列,应用生物信息学方法,对副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的理化性质、二级结构和B细胞抗原表位进行预测。结果显示,HipA蛋白的理论等电点为7.23,前50个氨基酸为信号肽,二级结构的预测结果显示该酶主要以α螺旋、无规则卷曲和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该蛋白有17个B细胞优势抗原表位区域。该研究为进一步研究分析副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的功能奠定理论基础。

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