文献类型： 中文期刊
作者： 郑将臣 1 ; 万全 2 ; 程起群 1 ; 赵金良 3 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所
2.安徽农业大学动物科技学院
3.上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室
关键词： 龟鳖类;R35基因;RAG2基因;遗传趋异;分子分类;系统进化
期刊名称： 大连海洋大学学报
ISSN： 2095-1388
年卷期： 2011 年 26 卷 05 期
页码： 76-81
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为从核基因的角度探讨龟鳖类的系统发育特征,采用PCR扩增和测序的方法,获得两种龟的R35内含子部分序列以及6种龟的RAG2基因部分序列,结合NCBI其它龟鳖的同源序列一并进行分析。结果表明:将R35序列比对后得到941 bp的一致序列,将RAG2比对后得到620 bp的一致序列,二者合并后,比对排序后得到1561 bp的一致序列,其中共有505个可变核苷酸位点,总变异率为32.35%;简约信息位点为239个,插入/缺失为139个,转换/颠换比率为1.64。碱基A、T、G、C的平均含量分别为29.5%、28.5%、22.8%、19.2%。海龟科和鳄龟科之间Kimura双参数(K-2-P)遗传距离最小(0.025),鳖科和南美侧颈龟科之间的遗传距离最大(0.182)。分子系统树结果显示:1)陆龟科与潮龟科先聚在一起,再与龟科聚在一起,陆龟科与潮龟科构成一个单系类群;2)支持陆龟总科与鳄龟科+海龟总科构成姐妹群;3)鳄龟科和海龟总科是姐妹群的关系。
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