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翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘士力 1 ; 贾永义 2 ; 蒋文枰 2 ; 迟美丽 2 ; 程顺 2 ; 赵金良 2 ; 顾志敏 2 ; 傅建军 3 ;

作者机构: 1.浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

2.;浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室

3.;浙江省淡水水产研究所农业部淡水渔业健康养殖重点实验室/浙江省淡水水产遗传育种重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部淡水渔业与种质资源利用重点实验室;

关键词: 翘嘴鲌;生长激素基因;克隆;序列分析

期刊名称: 浙江农业学报

ISSN: 1004-1524

年卷期: 2017 年 08 期

页码: 1281-1289

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用保守引物进行PCR成功扩增了编码翘嘴鲌生长激素的基因,该基因全长5 966 bp,其中转录单元长1 648 bp,由5个外显子和4个内含子组成。5'端和3'端侧翼序列长度分别为2 282 bp和2 036 bp,分别包含(AAT)8和(TTC)5T(TAA)8的微卫星序列。上游区域包含TATA框,还有一些重要的转录因子结合位点,如Pit-1、Pit-1a、CREB、AP1、GR、HNF-3、HNF-3B等转录因子。翘嘴鲌的5个外显子长度分别为64、140、117、162和255 bp。推测的阅读框为603 bp,编码由22个氨基酸的信号肽和178个氨基酸成熟肽组成的多肽。在这个多肽中发现了5个保守的半胱氨酸残基(Cys~(71)、Cys~(135)、Cys~(173)、Cys~(190)和Cys~(198))和2个可能的N-糖基化位点(145th和197th)。翘嘴鲌GH氨基酸序列与团头鲂完全相同,与草鱼只有一个氨基酸残基的差异,构建的鱼类进化树符合基本分类地位。翘嘴鲌生长激素基因4个内含子长度分别为229、103、565和103 bp。相对外显子来说,种间内含子变异较大,其中第三内含子变异最大。该结果为进一步研究翘嘴鲌GH基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。

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