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广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周炎花 1 ; 乔小燕 2 ; 马春雷 1 ; 乔婷婷 1 ; 金基强 1 ; 姚明哲 1 ; 陈亮 1 ;

作者机构： 1.中国农业科学院茶叶研究所

2.广东省农业科学院茶叶研究所

关键词： 茶树;遗传多样性;遗传结构;EST-SSR

期刊名称： 林业科学

ISSN： 1001-7488

年卷期： 2011 年 47 卷 03 期

页码： 61-69

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用设计合成的60对扩增稳定的EST-SSR核心引物分析51份广西茶树地方品种的遗传多样性和遗传结构,共检测到232个等位基因,每对引物检测到2～7个,平均3.88个。群体的观测杂合度(Ho)变化范围为0.02(TM149)～0.92(TM186),平均为0.37;期望杂合度(He)的变化范围为0.13(TM144,TM147)～0.73(TM189),平均为0.47;位点的多态信息含量(PIC)介于0.12～0.68之间,平均为0.41。地区间遗传相似系数在0.83～0.94之间,说明不同地区地方品种间的亲缘关系较近。对于茶与白毛茶群体而言,平均遗传分化系数为0.02(P<0.001),即有2%的遗传变异存在于群体间,而有98%的遗传变异存在于群体内。另外,种群内的近交系数Fis平均为0.21,说明群体内近交现象较严重。基于Nei’s遗传距离,利用PowerMarker3.25软件进行Neighbor-Joining聚类分析,将51份地方品种聚为3类:桂林、来宾和贺州的大部分品种,钦州和梧州的全部品种聚在第Ⅰ类;第Ⅱ类包含多数地区的品种;第Ⅲ类主要由崇左、防城港和南宁的品种组成。该结果与基于模型的遗传结构分析结果基本一致。

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