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紫芝栽培新品种武芝2号基于rDNA-ITS和ITS2的分子鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 钟礼义 1 ; 应正河 2 ; 刘新锐 3 ; 陈体强 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所

2.武平县食用菌技术推广服务站

3.福建农林大学

关键词： 紫芝;武芝2号;紫芝S2;rDNA;ITS/ITS2;序列分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2022 年 49 卷 002 期

页码： 9-15

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]探讨利用rDNA-ITS及其ITS2二级结构进行紫芝栽培新品种武芝2号(原名紫芝S2)的分子鉴定.[方法]通过第一代和第三代测序技术分别获得武芝2号的ITS序列,针对灵芝属(Ganoderma spp.)相关种类的ITS序列构建系统进化树进行分子分类鉴定,采用rDNA-ITS及相关引物序列进行BLAST比对分析,在线预测ITS2二级结构.[结果]Sanger法测序得到的武芝2号ITS序列(MG282563.1,649 bp),与GenBank中5个紫芝ITS序列具有高相似度(99.53%~100%),并且与已知4个紫芝菌株或实物标本在灵芝属系统进化树上聚为一个分支,同属一个种群.已知2个紫芝特异性引物短序列(GS1_22bp、GS2_22bp)出现在武芝2号ITS序列的119~140 bp正向和588~567 bp反向位置;在武芝2号基因组Scaffold No.49上rDNA中找到4个串联重复的ITS区域,与Sanger法测序得到的单个ITS序列高度一致;在ITS2序列二级结构上,武芝2号与ITS2数据库中紫芝Ganoderma sinense的3个螺旋区结构相同,仅螺旋IV区间夹角不同.[结论]基于ITS和ITS2分子鉴定,确认了武芝2号与已知紫芝G.sinense同属一个种群,在ITS2二级结构螺旋IV区存在夹角差异;此外,验证了2个已知紫芝特异性扩增引物的有效性.

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