您好，欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库！
福建省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

紫芝基因组rDNA序列特征及ITS2二级结构比较

文献类型： 中文期刊

作者： 陈体强 1 ; 徐晓兰 2 ; 石林春 2 ; 应正河 2 ; 钟礼义 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院食用菌研究所

2.null

关键词： 基因组;完整rDNA;基因内间隔区;ITS2二级结构;紫芝

期刊名称： 菌物学报

ISSN： 1672-6472

年卷期： 2023 年 42 卷 001 期

页码： 330-343

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 紫芝栽培品种'紫芝S2'(武芝2号)的ITS序列与NCBI数据库中5个紫芝菌株/分离株相似度高达99.79%-100%,在系统进化树上相聚成一类.本研究预测'紫芝S2'基因组与参考基因组中的rRNA基因簇,分析rDNA结构及各构件序列间的多态性.从高质量'紫芝S2'基因组中挖掘得到完整rDNA,序列全长40.377 kb,由4组串联重复的(18S、5.8S、28S、5S)rRNA基因簇组成,并含有完整的基因内间隔区(ITS1、ITS2)和基因间间隔区(IGS1、IGS2).在紫芝S2的rDNA中,高度保守的28SrRNA基因间出现3个SNP和2个插入(1bp,10bp)位点;虽然第4条ITS2中有1个SNP位点,但紫芝S2的4条ITS2在二级结构上的分子形态高度一致,与ITS2数据库中其他紫芝菌株仅存在螺旋区间夹角的微小差异.由'紫芝S2'基因组rDNA的ITS2生成的DNA条形码与二维码,可以作为该栽培品种鉴定与同源物种其他菌株鉴别的分子标记.

  • 相关文献

[1]紫芝超细粉挥发油成分GC-MS分析. 陈体强,吴锦忠,朱金荣. 2007

[2]柱前衍生与柱后衍生法检测紫芝药材中氨基酸. 陈丽艳,陈体强,徐洁. 2007

[3]紫芝栽培品种‘武芝2号’(‘紫芝S2’)全基因组测序及分析. 陈体强,徐晓兰,石林春,钟礼义. 2021

[4]鉴别紫芝菌株的PCR引物筛选及其序列比对验证. 钟礼义,陈体强,刘新锐,应正河,杨驰. 2020

[5]紫芝的子实体、担孢子形态及其营养成分. 陈体强,李开本,林兴生,徐洁,郑宇,林章余. 2001

[6]紫芝担孢子交配型的鉴定. 柯斌榕,卢政辉,吴小平,郭丽羡,兰清秀. 2016

[7]超临界流体萃取紫芝挥发油成分的GC-MS分析. 吴建国,王宏雨,吴岩斌,陈体强. 2012

[8]我国南方部分灵芝产区栽培品种调查鉴定与分析. 柯斌榕,卢政辉,吴小平,兰清秀,钟锦生. 2016

[9]紫芝超临界萃取物中3种三萜醇的分离与鉴定. 陈体强,吴锦忠,吴岩斌. 2012

[10]番鸭呼肠孤病毒的鉴定. 胡奇林,陈少莺,林锋强,程晓霞,林天龙,江斌,陈仕龙,程由铨,李怡英,朱小丽. 2004

[11]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015

[12]3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析. 杨维星,施少华,陈红梅,万春和,程龙飞,傅光华,林芳,林建生,苏敬良,黄瑜. 2010

[13]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[14]赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析. 徐晓兰,陈体强,兰进,陈向东,朱风丽,陈虎,石林春,陈士林. 2020

[15]光照诱导广叶绣球菌基因组甲基化分析. 肖冬来,马璐,张迪,王宏雨,林衍铨. 2017

[16]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[17]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[18]鸡肠道大肠杆菌多抗菌株C20耐药性基因的预测和分析. 田容川,黄薇. 2017

[19]基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异. 杨驰,马璐,肖冬来,江晓凌,刘晓瑜,林衍铨. 2021

[20]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：福建省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台