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串联重复序列的物种差异及其生物功能

文献类型: 中文期刊

作者: 高焕 1 ; 孔杰 2 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室

2.中国科学院海洋研究所

关键词: 串联重复序列;微卫星;小卫星;基因组;起源与进化

期刊名称: 动物学研究

ISSN: 0254-5853

年卷期: 2005 年 26 卷 05 期

页码: 105-114

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 串联重复序列是指1-200个碱基左右的核心重复单位,以头尾相串联的方式重复多次所组成的重 复序列。它广泛存在于真核生物和一些原核生物的基因组中,并表现出种属、碱基组成等的特异性。在基因组 整体水平上,各种优势的重复序列类型不同。即使在同一重复序列类型内部,不同重复拷贝类别(如AT、AC 等)在基因组中的存在也表现出很大的差异。同时,这些重复序列类型和各重复拷贝类别在同一物种的不同染 色体间,以及基因的编码区和非编码区间也表现种属和碱基组成差异。这些差异显示了重复序列起源和进化的 复杂性,可能涉及到多种机制和因素,并与生物功能密切相关。另外,由于重复序列分析软件和统计标准还存 在算法、重复长度、完美性等问题,需要进一步探讨。此外,串联重复序列的自身进化关系、全基因组水平上 的进化地位、在基因组中的生物功能、重复序列数据库建立和应用研究等,将是今后研究的主要课题。

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