文献类型： 中文期刊

作者： 杨泽禹 ¹ ; 廖梅杰 ¹ ; 王印庚 ¹ ; 张正 ¹ ; 韦信贤 ¹ ; 李彬 ¹ ; 荣小军 ¹ ;

作者机构： 1.上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室;广西水产科学研究院

关键词： 急性肝胰腺坏死病(AHPND);副溶血弧菌;地榆;内参基因;qRT-PCR

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 150-158

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为筛选适用于研究地榆(Sanguisorba officinalis L.)对对虾急性肝胰腺坏死病致病株副溶血弧菌(Acute hepatopancreatic necrosis disease caused by Vibrio parahaemolyticus, VP_(AHPND))抑制机理的内参基因,本文探究了地榆醇提物胁迫下VP_(AHPND)生长的变化,并利用qRT-PCR技术探究了该条件下VP_(AHPND)中6种常见内参基因(rec A、pvs A、pvu A、gapdh、16S rRNA和rpo S)的表达情况,利用GeNorm、Norm Finder、Best Keeper、Delta CT以及Ref Finder这5种方法对其表达稳定性进行了评估和筛选。结果显示,地榆醇提物能抑制VP_(AHPND)的生长,且抑制效果与浓度呈正相关。在不同浓度地榆醇提物处理条件下,这6种内参基因扩增产物特异性良好,其中,Ct值变化差异最小的为16S rRNA (CV=3.88),变化差异最显著的为pvs A (CV=12.53)。5种方法对6种内参基因稳定性排序略有差异,其中,GeNorm给出的稳定性排序为rpo S=16S rRNA> gapdh> rec A> pvu A> pvs A;Norm Finder结果为gapdh> rpo S> pvu A> 16S rRNA> rec A> pvs A;Best Keeper结果为16S rRNA> rpo S> gapdh> rec A> pvu A> pvs A;Delta Ct结果为gapdh> rpo S> pvu A> 16S rRNA> rec A> pvs A;Ref Finder综合排名结果为rpo S> gapdh> 16S rRNA>pvu A> pvs A> rec A。本研究根据配对变异系数结果,最终推荐同时使用rpo S和gapdh作为该条件下内参基因。本研究为以地榆为核心药物的AHPND防控技术的建立和从基因表达角度研究地榆对VP_(AHPND)的作用机理提供了基础。