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拟穴青蟹β-肌动蛋白基因的克隆、组织表达及作为内参的可靠性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 徐真 1 ; 马洪雨 1 ; 马春艳 1 ; 冯娜娜 1 ; 李新苍 1 ; 李淑娟 1 ; 蒋伟 1 ; 马凌波 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院东海水产研究所农业部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室

关键词: 拟穴青蟹;β-肌动蛋白基因;基因克隆;组织表达;内参

期刊名称: 生物技术通报

ISSN: 1002-5464

年卷期: 2013 年 0 卷 08 期

页码: 105-112

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR和RACE技术,从拟穴青蟹肌肉组织中鉴定出β-actin基因的cDNA全序列。序列分析结果表明,拟穴青蟹β-actin基因全长1 434 bp,包括完整的开放阅读框1 131 bp、5'端非翻译区60 bp及3'端非翻译区243 bp。该基因编码376个氨基酸,蛋白分子量为41.79 kD,等电点为5.205。同源性比较表明,该基因与其它物种具有高度的氨基酸保守性。聚类分析表明,拟穴青蟹与百慕大陆蟹的亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明,β-actin基因在拟穴青蟹血液、心脏、肝胰腺、胃、鳃、肌肉、精巢、结缔组织组织中均有表达,在肌肉组织中的表达量最高,在胃、精巢、血液、肝胰腺、心脏、鳃组织中的表达量依次降低,在结缔组织中的表达量最低。由于该基因在拟穴青蟹不同组织中的表达量存在明显的差异,因此不适用于作为内参基因使用。

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