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利用DNA池技术提高基于InDel标记的种子纯度鉴定效率

文献类型: 中文期刊

作者: 兰青阔 1 ; 余景会 1 ; 赵新 1 ; 王永 1 ; 张桂华 2 ; 朱珠 1 ; 陈锐 1 ; 李欧静 1 ; 郭永泽 1 ; 程奕 1 ;

作者机构: 1.天津市农业科学院中心实验室

2.天津科润农业科技股份有限公司黄瓜研究所

关键词: DNA池;InDel标记;焦磷酸测序技术;黄瓜;种子纯度鉴定

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2012 年 31 卷 02 期

页码: 31-33+38

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为提高基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测通量,降低检测成本,本研究模拟10种DNA Pooling进行PCR、Pyrosequencing及等位基因频率分析。通过TTest分析不同Pooling间等位基因频率的差异性,确定3 Pooling为种子纯度检测最适Pooling数;建立3 Pooling-InDel-Pyrosequencing标准曲线,其R2达0.999 1;根据该标准曲线,检测黄瓜杂交品种"园中王"30粒杂交种种子纯度,结果为96.67%。本研究丰富了基于InDel-Pyrosequencing的黄瓜杂交种纯度检测技术体系。

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