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利用基因组重测序技术鉴定彭阳县夏洛莱牛的纯度

文献类型： 中文期刊

作者： 何亮宏 1 ; 杨启文 2 ; 邓占钊 1 ; 王楠 2 ; 雷初朝 2 ; 梁小军 3 ;

作者机构： 1.彭阳县畜牧技术推广服务中心

2.西北农林科技大学动物科技学院

3.宁夏农林科学院动物科学研究所

关键词： 夏洛莱牛;全基因组重测序;遗传结构;纯度

期刊名称： 中国牛业科学

ISSN： 1001-9111

年卷期： 2024 年 50 卷 005 期

页码： 1-5

摘要： [目的]对宁夏彭阳县10头夏洛莱牛进行全基因组重测序,并与下载的48头牛的全基因组重测序数据进行比对分析,以鉴定彭阳县10头夏洛莱牛的纯度.[方法]利用全基因组重测序技术和生物信息学分析方法.[结果]通过对彭阳县10头夏洛莱牛全基因组数据进行分析,共检测到17,583,444个SNP位点,其基因组的核苷酸多样性(0.0016)稍微高于欧洲普通牛(0.0012)和东亚普通牛(0.0011).遗传结构分析表明,当K=3时,10头彭阳县夏洛莱牛主要为欧洲普通牛血统(64.10%~95.54%),其次是东亚普通牛血统(0.00%~32.25%)和中国瘤牛血统(3.09%~13.51%),说明彭阳县10头夏洛莱牛都存在不同程度的东亚普通牛和中国瘤牛血统.[结论]基于全基因组重测序分析,彭阳县10头夏洛莱牛均为杂交牛.

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[1]西瓜杂交制种技术研究. 王志强,刘声锋,田梅,郭守金,李程,黄莉. 2010

[2]基于SSR标记的255个枣品种亲缘关系和群体遗传结构分析. 刘秀云,李慧,刘志国,赵锦,刘孟军. 2016

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