文献类型： 中文期刊

作者： 王骞 ¹ ; 包慧芳 ² ; 丁荣荣 ³ ; 史应武 ² ; 杨红梅 ² ; 楚敏 ² ; 王宁 ² ;

作者机构： 1.新疆维吾尔自治区土壤肥料工作站

2.新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物重点实验室

3.新疆生产建设兵团第七师农业科学研究所

关键词： 枯草芽孢杆菌;全基因组测序;比较基因组;生物膜

期刊名称： 草食家畜

ISSN： 1003-6377

年卷期： 2022 年 005 期

页码： 56-64

摘要： 为深入挖掘和利用枯草芽孢杆菌及其基因资源,本研究利用BGISEQ-50平台对一株具有生防潜力的B. subtilis DNKAS进行了全基因组测序,通过基因组装、基因预测和功能注释,与其他8株枯草芽孢杆菌进行了比较基因组分析。结果显示:DNKAS基因组大小为4.15Mb,GC含量为43.42%,预测编码基因4 359个。在DNKAS基因组中注释到4 217个基因具有直系同源蛋白簇分类。比较基因组分析表明:DNKAS符合枯草芽孢杆菌基因组的基本特征,与其他8株枯草芽孢杆菌共有1 354个同源基因。DNKAS中与生物膜形成相关基因26个,其中编码XRE家族转录调控因子、HTH型转录调控基因等涉及生物膜通透性、脂类合成相关基因均与B. subtilis NCD-2对应的功能基因相同，两株菌在PTS系统，糖特异性IIA成分基因存在较大差异。对DNKAS全基因组序列的注释和功能分析，为深入研究其定殖特性和作用机制,并更有效地利用其防控杂草列当提供了基础。