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二穗短柄草(Brachypodium distachyon)BdCO基因调控开花的转录组学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨龙姣 1 ; 路雪萍 2 ; 童伟杨 2 ; 马培杰 3 ; 罗文举 1 ; 陈才俊 3 ; 王小利 3 ;

作者机构: 1.贵州大学动物科学学院

2.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院

3.贵州省农业科学院草业研究所

关键词: 二穗短柄草;BdCO基因;转录组学;光周期

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 602-615

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: CONSTANS(CO)是植物光周期诱导开花途径中的关键基因之一。为探究BdCO在光周期途径中的分子调控机制,本研究对野生型二穗短柄草(Brachypodium distachyon)Bd21植株、过表达BdCO基因型二穗短柄草(CO_OX)植株和BdCO基因敲除型二穗短柄草(CO_A3)植株进行转录组测序分析,对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析,最后观察三种植株的开花表型。结果表明,对比Bd21 vs CO_OX和Bd21 vs CO_A3的基因表达量,分别检测到1 382个和773个差异表达基因;GO功能富集分析发现,Bd21 vs CO_OX的差异表达基因主要富集在小核仁核糖核蛋白复合物、 snoRNA结合和rRNA处理中,Bd21 vs CO_A3的差异表达基因主要富集在类囊体、色素结合和光合作用中;KEGG通路富集分析发现,Bd21 vs CO_OX的差异表达基因主要富集在植物激素信号转导、真核生物中的核糖体生物发生、光合作用-天线蛋白和昼夜节律-植物等通路,Bd21 vs CO_A3的差异表达基因主要富集在MAPK信号通路-植物、真核生物中的核糖体生物发生和光合作用-天线蛋白等通路;在长日照条件下,CO_OX植株的开花时间比野生型Bd21的提前约1.90 d, CO_A3植株的开花时间比野生型Bd21的延迟约7.92 d。综上,BdCO影响光周期途径相关基因的表达,同时影响二穗短柄草的开花时间,说明BdCO在二穗短柄草的光周期途径调控开花的过程中发挥重要作用。

  • 相关文献

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[2]二穗短柄草BdCO基因表达与生物学功能分析. 路雪萍,童伟杨,舒健虹,马培杰,赵德刚,王小利. 2022

[3]茎尖离体培养小黄姜变异株品质特征及转录组学分析. 侯颖辉,王少铭,罗莉斯,李晋华,冷家归,汪志燚,李德文. 2023

[4]高羊茅FaGI基因在拟南芥中异源表达及蛋白互作分析. 路雪萍,马培杰,童伟杨,罗文举,李亚娇,赵德刚,王小利. 2023

[5]火龙果开花调控转录因子基因HpSOC1的克隆与表达分析. 严佳文,解璞,袁启凤,肖图舰,毛永亚,马玉华. 2018

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[7]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022

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