您好,欢迎访问天津市农业科学院 机构知识库!

贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 兰青阔 1 ; 陈锐 1 ; 赵新 1 ; 王成 1 ; 陈笑芸 2 ; 汪小福 2 ; 沈晓玲 1 ; 刘娜 1 ; 朱珠 1 ; 刘征辉 1 ; 王永 1 ;

作者机构: 1.天津市农业质量标准与检测技术研究所

2.null

关键词: 贝母;叶绿体基因组;单核苷酸多态性位点;生物信息学分析

期刊名称: 食品安全质量检测学报

ISSN: 2095-0381

年卷期: 2018 年 17 期

页码: 4527-4533

摘要: 目的分析贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的分布特点、鉴别能力和应用价值,为中药材贝母精准鉴定方法的建立提供技术支撑。方法应用多重序列比对、SNP筛选、酶切位点分析等生物信息学分析手段,对贝母属6种药用植物的15条叶绿体基因组序列进行分析。结果贝母属叶绿体基因组DNA同源性达98.38%,通过分析共发现SNP位点4058个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,瓦布贝母鉴别候选位点个25个,太白贝母鉴别候选位点个120个,浙贝母鉴别候选位点个79个,湖北贝母鉴别候选位点个61个,平贝母鉴别候选位点794个。结论叶绿体基因组SNP分子标记因其密度高、鉴别力强和便于分析的特点,具有较大的应用价值。

  • 相关文献

[1]贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析. LAN Qing-Kuo,兰青阔,CHEN Rui,陈锐,ZHAO Xin,赵新,WANG Cheng,王成,CHEN Xiao-Yun,陈笑芸. 2018

[2]贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析. 兰青阔,赵新,陈锐,王成,陈笑芸,汪小福,王永,兰璞. 2020

[3]小菜蛾p38 MAPK基因的克隆与生物信息学分析. 胡霞,谷希树,刘晓琳,白义川,徐维红,刘佰明,许静杨. 2013

[4]水稻α-NAC基因家族的克隆及生物信息学分析. 王晓静,孙林静,马忠友,孙玥,李军玲,张融雪,闫双勇,刘学军. 2016

[5]小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析. 胡霞,刘晓琳,白义川,徐维红,刘佰明,邹德玉,许静杨,谷希树. 2017

[6]谷子SiCDPK9基因的克隆、亚细胞定位与盐胁迫下表达分析. 崔燕娇,刘丹,李素英,张静,刘正理. 2025

[7]辣椒炭疽病病原菌中分泌蛋白的预测及特性分析. 李明瑾,霍建飞,韩长志,姚玉荣,贲海燕,郝永娟,王万立. 2025

作者其他论文 更多>>