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猪流行性腹泻病毒TaqMan荧光定量PCR方法的建立与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 李彬 1 ; 刘浩飞 2 ; 孙冰 2 ; 茅爱华 2 ; 杜露平 2 ; 何孔旺 2 ; 郭容利 2 ; 温立斌 2 ; 张雪寒 2 ; 倪艳秀 2 ; 周俊明 2 ; 吕立新 2 ; 俞正玉 2 ; 王小敏 2 ; 胡屹屹 2 ; 祝昊丹 2 ; 于洋 2 ;

作者机构: 1.江苏省农业科学院兽医研究所

2.江苏省农业科学院兽医研究所,农业部兽用生物制品工程技术重点实验室

关键词: 猪流行性腹泻病毒;TaqMan荧光定量PCR;流行病学调查

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2014 年 30 卷 01 期

页码: 125-129

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为定量检测猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV),建立了检测PEDV的TaqMan荧光定量PCR方法。根据PEDV基因组中保守的N基因序列设计引物和探针,以梯度稀释的含有N基因的重组质粒作为标准品,进行定量PCR反应。结果表明,该试验建立的荧光定量PCR方法在1μl 101~109拷贝之间具有良好的线性关系,相关系数达到0.99以上,扩增效率在90%与100%之间。该方法的检测灵敏度为10拷贝,与常规RT-PCR方法相比,该方法敏感性更高,而且该检测方法特异性较好,与猪的其他病毒核酸均无交叉反应,批内和批间的变异系数均低于3%,表明该方法的重复性较好。对华东地区采集的130份临床样品进行检测,结果显示,PEDV的阳性率为63.1%。

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