文献类型： 中文期刊

作者： 阮瑞 ¹ ; 吴金平 ² ; 李营 ² ; 岳华梅 ² ; 李创举 ² ; 乔新美 ² ; 熊伟 ² ; 陈细华 ³ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所

2.;中国水产科学研究院长江水产研究所

3.;中国水产科学研究院长江水产研究所;

关键词： 达氏鳇(Huso dauricus);肠道微生物;菌群结构;梭菌属(Clostridium)

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 93-98

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解达氏鳇肠道微生物组成特征,采集6尾喂养人工配制饲料4周的达氏鳇后肠内容物分别提取DNA,并利用16S r RNA V3-V4变异区扩增子高通量测序的方法分析达氏鳇幼鱼肠道微生物组成与多样性。结果显示:6个样本共获得541575条有效序列,73个操作分类单元(OTUs)。73个OTUs隶属于7个门,其绝对优势菌群在门、目、科、属分类水平上分别为厚壁菌门(98.253%)、梭菌目(98.216%)、梭菌科(98.137%)、狭义梭菌属(92.892%)。序列注释发现,梭菌属中绝大部分为具有降解糖类为短链脂肪酸功能的Clostridium colicanis。此外,还分布有少量的分节丝状菌(3.99%)、鲸杆菌属(1.22%)等菌群。