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三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建与群体遗传分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李晓萍 1 ; 刘萍 2 ; 宋协法 1 ;

作者机构: 1.中国海洋大学

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词: 三疣梭子蟹;富集文库;菌落原位杂交;微卫星标记;遗传多样性

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2011 年 18 卷 01 期

页码: 194-201

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用富集文库–菌落原位杂交法分离了30个三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)的微卫星标记。三疣梭子蟹基因组DNA经HaeⅢ酶切连接后,用固定了(AC)15和(AG)15探针的尼龙膜(Hybond N+)捕捉含有微卫星的片段,转化至大肠杆菌DH5α中,构建三疣梭子蟹微卫星富集文库。菌落原位杂交后,任意选取150个克隆进行测序,阳性克隆率为85.48%。利用软件设计了105对微卫星引物,筛选到稳定扩增标记56对,采用30个三疣梭子蟹个体进行多样性评价,30个位点均表现出多态性。观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量(PIC)的范围分别为0.222 2~1.000 0、0.436 7~0.909 9和0.350~0.892。本研究筛选的微卫星位点将为下一步三疣梭子蟹遗传多样性分析、家系分析、遗传图谱构建和QTL定位等研究提供基础依据。

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