文献类型： 中文期刊
作者： 刘政 1 ; 李燕 2 ; 孙艳 1 ; 张学坤 1 ; 陈兵 1 ; 王琦 2 ;
作者机构： 1.新疆农垦科学院植物保护研究所
2.中国农业大学植物病理学系植物病害生物防治与微生态实验室
关键词： 棉花黄萎病;内生细菌;变性梯度凝胶电泳;群落结构
期刊名称： 棉花学报
ISSN： 1002-7807
年卷期： 2016 年 28 卷 02 期
页码： 170-178
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了研究黄萎病菌侵染条件下内生细菌群落结构多样性变化,以不同时期健康棉株和感染黄萎病菌(Verticillium dahliae)的棉株根部组织为材料,提取样品总DNA,扩增内生细菌16S r DNA的V3可变区,将扩增产物进行变性梯度凝胶电泳分析,并对21个优势条带进行切胶回收、克隆测序,构建系统发育树。结果表明:不同时期发病棉株和健康棉株样品可以聚成2大类,一是苗期和蕾期的根部样品,二是初花期和结铃期的根部样品;感染黄萎病棉株内生细菌种类多样性下降;BLAST比对结果发现21个克隆序列与Gen Bank数据库中已知16S r DNA基因序列同源性很高(99%~100%),绝大多数属于变形菌门(Proteobacteria),占总克隆序列的80.95%,其他不可培养细菌占19.05%。说明黄萎病菌的侵染能明显影响内生细菌群落结构多样性。
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