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猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 修金生 1 ; 胡崇伟 1 ; 陈如敬 2 ; 王斌 1 ; 李涛 1 ; 陈秋勇 1 ; 林群群 1 ;

作者机构: 1.福建农林大学动物科学学院

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

关键词: 猪嵴病毒;基因组;基因结构;序列分析

期刊名称: 中国人兽共患病学报

ISSN: 1002-2694

年卷期: 2013 年 29 卷 11 期

页码: 1076-1079

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 目的为研究猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)福建株的基因组结构特征。材料与方法根据猪嵴病毒基因组特征设计特异性引物,运用RT-PCR方法,对猪嵴病毒福建株进行全基因克隆,并运用RACE方法对猪嵴病毒福建株的5’和3’末端进行扩增。结果与结论所获得的猪嵴病毒福建株基因组全长为8 210bp,其5’末端长度为576bp,3’末端长度为167bp,编码一个大的多聚蛋白,长度为7 467bp,编码2 488个氨基酸。其多聚蛋白核苷酸同源性和我国猪嵴病毒分离株CH/HNXX-4/2012(GenBank登录号JX401523)同源性最高,均为89.2%,和匈牙利猪嵴病毒分离株swine/S-1-HUN/2007/Hungary(GenBank登录号(GenBank登录号EU787450)同源性最低,达87.6%。

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