您好,欢迎访问福建省农业科学院 机构知识库!

3株鸭肝炎病毒1型全基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨维星 1 ; 施少华 1 ; 陈红梅 1 ; 万春和 1 ; 程龙飞 1 ; 傅光华 1 ; 林芳 1 ; 林建生 1 ; 苏敬良 2 ; 黄瑜 1 ;

作者机构: 1.福建省农科院畜牧兽医研究所

2.中国农业大学动物医学院

关键词: 鸭肝炎病毒1型;基因组;序列分析

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2010 年 26 卷 14 期

页码: 8-12

收录情况: 北大核心

摘要: 为分析3株1型鸭肝炎病毒(DHV)的遗传变异和进化关系;采用RT-PCR和5'-/3'-RACE.方法测定3株1型鸭肝炎病毒全基因序列;研究结果表明,不含poly(A)尾巴的3株病毒的基因组全长为7691~7700nt,基因组均仅含一个长度为6750nt的ORF,625~627nt5'端非翻译区和325~328nt3'端非翻译区(UTR)。将3株病毒株与GeneBank公布的其他DHV-1全基因序列及小RNA病毒科的其他属代表病毒株进行序列分析表明,聚蛋白均被分割成为12个蛋白,其中VP1的变异性最大,180~187位为高变区。3株病毒与DHV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.7%~98.8%,氨基酸序列同源性在96.9%~98.8%,DHV-1各株在小RNA科病毒多聚蛋白氨基酸序列进化树上形成一个独立的进化分支;DHVs-1病毒间核苷酸和氨基酸仍较保守,它们在进化中可将其归为小RNA病毒科的一个新属。

  • 相关文献

[1]鸭圆环病毒基因组序列分析及其C1截短基因的原核表达. 施少华,陈珍,杨维星,傅光华,程龙飞,陈红梅,彭春香,黄瑜. 2009

[2]甘薯曲叶病毒福建省分离物的分子鉴定. 李华伟,刘中华,张鸿,林志坚,李国良,林赵淼,许泳清,邱永祥,罗文彬,纪荣昌,汤浩,邱思鑫. 2018

[3]樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析. 万春和,陈翠腾,刘荣昌,程龙飞,施少华,傅光华,陈红梅,傅秋玲,黄瑜. 2018

[4]猪嵴病毒福建株全基因克隆及序列分析. 修金生,胡崇伟,陈如敬,王斌,李涛,陈秋勇,林群群. 2013

[5]鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析. 施少华,傅光华,程龙飞,陈红梅,万春和,陈珍,彭春香,林芳,黄瑜. 2010

[6]番鸭呼肠孤病毒的鉴定. 胡奇林,陈少莺,林锋强,程晓霞,林天龙,江斌,陈仕龙,程由铨,李怡英,朱小丽. 2004

[7]香蕉Ran家族基因的全基因组分析. 张雅玲,方智振,赖钟雄. 2015

[8]赤芝全基因组SSR位点的筛选及种质资源遗传多样性分析. 徐晓兰,陈体强,兰进,陈向东,朱风丽,陈虎,石林春,陈士林. 2020

[9]光照诱导广叶绣球菌基因组甲基化分析. 肖冬来,马璐,张迪,王宏雨,林衍铨. 2017

[10]鸡肠道大肠杆菌多抗菌株C20耐药性基因的预测和分析. 田容川,黄薇. 2017

[11]基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异. 杨驰,马璐,肖冬来,江晓凌,刘晓瑜,林衍铨. 2021

[12]18个双孢蘑菇核心种质的重测序初步分析. 施肖堃,蔡志欣,郭仲杰,卢园萍,陈美元,廖剑华. 2019

[13]草莓Metacaspase基因家族全基因组鉴定及表达分析. 郑益平,陈坚,朱炳耀. 2020

[14]特色农业微生物基因组研究系统的建立. 郑斯平,陈彬,宋亚娜,关雄,郑伟文. 2010

[15]紫芝基因组rDNA序列特征及ITS2二级结构比较. 陈体强,徐晓兰,石林春,应正河,钟礼义. 2023

[16]基于高通量测序的福安刺葡萄基因组初步研究. 陈婷,周平,刘鑫铭,蔡盛华,雷龑. 2017

[17]鹅圆环病毒研究进展. 万春和,黄瑜. 2015

[18]基因Ⅵb亚型半番鸭源新城疫病毒基因组测序及分析. 黄秋芳,孙敏华,陈少莺,吕殿红,董嘉文,尚毅,吴玄光,胡奇林. 2012

[19]生物信息学在药用植物研究中的应用. 郑斯平,陈彬,周莉娟. 2005

[20]种番鸭源禽坦布苏病毒分离鉴定及基因组序列分析. 傅光华,陈红梅,黄瑜,万春和,傅秋玲,程龙飞,施少华,林建生. 2014

作者其他论文 更多>>