文献类型: 中文期刊
作者: 杨维星 1 ; 施少华 1 ; 陈红梅 1 ; 万春和 1 ; 程龙飞 1 ; 傅光华 1 ; 林芳 1 ; 林建生 1 ; 苏敬良 2 ; 黄瑜 1 ;
作者机构: 1.福建省农科院畜牧兽医研究所
2.中国农业大学动物医学院
关键词: 鸭肝炎病毒1型;基因组;序列分析
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2010 年 26 卷 14 期
页码: 8-12
收录情况: 北大核心
摘要: 为分析3株1型鸭肝炎病毒(DHV)的遗传变异和进化关系;采用RT-PCR和5'-/3'-RACE.方法测定3株1型鸭肝炎病毒全基因序列;研究结果表明,不含poly(A)尾巴的3株病毒的基因组全长为7691~7700nt,基因组均仅含一个长度为6750nt的ORF,625~627nt5'端非翻译区和325~328nt3'端非翻译区(UTR)。将3株病毒株与GeneBank公布的其他DHV-1全基因序列及小RNA病毒科的其他属代表病毒株进行序列分析表明,聚蛋白均被分割成为12个蛋白,其中VP1的变异性最大,180~187位为高变区。3株病毒与DHV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.7%~98.8%,氨基酸序列同源性在96.9%~98.8%,DHV-1各株在小RNA科病毒多聚蛋白氨基酸序列进化树上形成一个独立的进化分支;DHVs-1病毒间核苷酸和氨基酸仍较保守,它们在进化中可将其归为小RNA病毒科的一个新属。
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