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连云港地区野生灵芝生物学特性及基因组特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 纪伟 1 ; 苏文英 1 ; 刘晓梅 1 ; 任立凯 1 ; 胡曙鋆 2 ; 孙潇潇 2 ; 陈克龙 3 ;

作者机构: 1.连云港市农业科学院

2.连云港市园艺蔬菜指导站

3.青海师范大学

关键词: 灵芝;生物学特性;全基因组重测序;主成分分析

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 223-232

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 野生灵芝资源在连云港境内有着广泛的分布,本研究使用全基因组重测序技术对具有不同形态特征和生境特点的灵芝基因组进行测序及分析,以期解析连云港地区野生灵芝的生物学特性及基因组特征。结果表明,从不同区域采集的野生灵芝种质资源菌丝具有锁状联合,具备形成子实体的条件,生物学特性存在较大差异;通过主成分分析将12株野生灵芝菌株种质资源聚为3类,其中第Ⅲ类具有更丰富的遗传多样性;比较单核苷酸多态性(SNP)、插入或者缺失(InDel)在12株灵芝菌株基因组中的分布情况发现,第1条染色体中的SNP最多,占比为46.07%,SNP中转换颠换比(Ts/Tv)为2.03,说明变异以转换为主,插入或缺失导致的基因差异在第1条染色体上最多,占总InDel数的44.31%。研究结果说明,连云港地区灵芝具有丰富的遗传多样性,可以用于进一步挖掘更多的功能基因和进行品种选育。

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