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不同熔解曲线分析技术在犬细小病毒基因分型中的比较

文献类型： 中文期刊

作者： 嘎利兵嘎 1 ; 锡林塔娜 2 ; 刘志成 3 ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学职业技术学院

2.锡林郭勒盟生态环境监测站

3.广东省农业科学院动物卫生研究所

关键词： HRM-PCR;FMCA-PCR;CPV-2;基因分型;熔解温度

期刊名称： 中国兽医杂志

ISSN： 0529-6005

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 32-37,42

收录情况： 北大核心

摘要： 本试验旨在建立基于聚合酶链式反应（PCR）技术的犬细小病毒2型（CPV-2）2种不同熔解曲线技术基因分型方法,并通过比较其熔解温度差异（△Tm）评价不同方法对犬细小病毒单核苷酸多态性（SNP）位点的分型鉴别能力。结果显示,探针熔解曲线聚合酶链式反应（FMCA-PCR）方法中不同SNP位点之间熔解温度差异（△Tm）均大于3℃,而在高分辨率熔解曲线聚合酶链式反应（HRM-PCR）方法中熔解温度差异（△Tm）只有0.2～0.6℃。临床30份CPV-2核酸样本基因分型结果显示,FMCA-PCR方法的准确率为100%;而HRM-PCR方法准确率为96.6%（未形成杂合子前）。虽然HRM-PCR方法中不同SNP位点之间熔解温度差异较小,影响其基因分型结果,但通过杂合子HRM分析后可提高该方法的准确率。本试验结果表明,基于PCR方法的2种不同熔解曲线基因分型技术均具有较好的SNP位点分型鉴别能力,为熔解曲线基因分型技术在兽医临床中的应用提供实际参考依据。

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[3]广东地区副猪嗜血杆菌KRG血清分型及基因分型多态性分析. 贾爱卿,李春玲,王贵平,杨冬霞,何丽丽. 2010

[4]中国鼠疫现况与基因分型. 张涛,冯志勇,杨林,姚丹丹. 2010

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[6]宽皮柑橘单核苷酸多态性的高分辨率熔解曲线分型. 吴波,杨润婷,朱世平,钟云,姜波,曾继吾,钟广炎. 2012

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