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水稻黑条矮缩病毒基因组片段S9的cDNA克隆和全序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张恒木 1 ; 陈剑平 1 ; 程晔 1 ; 雷娟利 1 ; 薛庆中 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院病毒学实验室!杭州310021,浙江大学农业与生物技术学院,杭州310029,浙江省农业科学院病毒学实验室!杭州310021,浙江省农业科学院病毒学实验室!杭州310021,浙江省农业科学院病毒学实验室!杭州310021,浙江大学农业与生物技术学院!杭州310029

关键词： 水稻黑条矮缩病毒;基因组片段S9;序列分析

期刊名称： 生物化学与生物物理学报

ISSN： 0582-9879

年卷期： 2001 年 04 期

页码： 467-471

收录情况： SCI ; 北大核心 ; CSCD

摘要： 应用RT PCR技术克隆了 3个中国水稻黑条矮缩病毒 (riceblack streakeddwarfvirus,RBSDV)分离株基因组片段S9,并测定了它们的全序列。结果表明 :RBSDV浙江分离株 (RBSDV Zj)基因组片段S9全长 190 0nt(EMBL登录号为AJ2 97430 ) ,RBSDV河北分离株 (RBSDV Heb)基因组片段S9全长 1898nt(EMBL登录号为AJ2 9742 9) ,湖北分离株S9全长 190 0nt(EMBL登录号为AJ2 9170 6 )。 3个分离株S9均含有两个开放阅读框(ORF) ,分别编码约 40kD和 2 4kD的多肽。3个中国分离株之间的核苷酸同源性高达 98.5 %～ 98.8% ,与日本分离株S9的核苷酸同源性均为 89.9%～ 90 .2 % ,而与意大利MRDVS8同源性仅为 85 .3%～ 86 .4%。我们发现ORF2十分保守 ,4个RBSDV分离株S9的ORF2同源性高达为 97.6 %～ 10 0 % ,与意大利MRDVS8的ORF2同源性也高达 94.3%。

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