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醉马草免培养内生细菌的多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 张雪兵 1 ; 史应武 1 ; 曾军 1 ; 娄恺 1 ;

作者机构： 1.新疆农业科学院微生物应用研究所

关键词： 醉马草;内生细菌;免培养法;生物多样性

期刊名称： 生态学报

ISSN： 1000-0933

年卷期： 2011 年 31 卷 08 期

页码： 2178-2187

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库。对筛选到249个克隆进行HaeШ酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs)。系统发育分析将其归为4个门:变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群。其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16SrRNA基因序列相似性(97%—100%),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacterium spp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富。另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%。研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群。

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