您好,欢迎访问上海市农业科学院 机构知识库!

萱草不同器官实时荧光定量PCR内参基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 梁锦 1 ; 刘海婷 1 ; 钟荣 1 ; 李昊 1 ; 尹冬梅 1 ; 刘翔 1 ; 秦巧平 1 ; 张志国 1 ; 段可 2 ; 倪迪安 1 ;

作者机构: 1.上海应用技术大学生态技术与工程学院

2.上海市农业科学院林木果树研究所上海设施园艺技术重点实验室

关键词: 萱草;不同器官;内参基因;实时荧光定量PCR

期刊名称: 植物生理学报

ISSN: 2095-1108

年卷期: 2020 年 009 期

页码: 1891-1898

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据我们之前的萱草(Hemerocallis fulva)转录组测序结果,采用生物信息学方法筛选用于实时荧光定量PCR的候选内参基因,并以萱草的根、茎、幼叶和三个发育阶段的花(长度约4 cm的幼嫩花蕾、长度约7 cm的即将开放的花蕾和开放的花朵)为材料,通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)测定通过转录组分析筛选到的6个候选内参基因(HfADF、HfTUB、HfGAPDH、HfTIP41、HfEF-1α和HfUBQ)在各样品中的表达量.使用统计软件geNorm、NormFinder和BestKeeper对上述6个候选内参基因进行了评估.结果表明:这些候选内参基因在不同样品中的表达量存在明显差异,适用于萱草不同器官研究的最优内参基因为HfTIP41和HfGAPDH.本研究首次评价了萱草内参基因稳定性,为该物种基因表达分析提供参考.

  • 相关文献

[1]西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选. 周琳,蔡友铭,杨柳燕,赵冰雪,李芳,张永春. 2020

[2]葡萄实时定量PCR中稳定内参基因的筛选. 查倩,奚晓军,蒋爱丽,田益华,王世平. 2016

[3]大麦苗期耐低氮性研究. 陈志伟. 2018

[4]百合体胚诱导、发育及不同组织实时定量PCR内参基因筛选. 陈敏敏,张茹佳,查倩,杨柳燕,李心,殷丽青,张永春. 2018

[5]利用不同实时定量PCR方法分析相对基因表达差异. 余舜武,刘鸿艳,罗利军. 2007

[6]草菇谷胱甘肽还原酶基因受低温影响的表达研究. 赵妍,马丹丹,姜威,颜素雅,陈明杰. 2015

[7]草菇不同菌株木聚糖酶xyn基因的表达及其酶活性分析. 王孟兰,赵妍,陈明杰,汪虹. 2014

[8]香菇菌丝转色过程中生理指标检测与分析. 管婉,储婷,鲍大鹏,万佳宁,李福后,唐利华. 2021

[9]金针菇tps1基因序列分析及不同温度下tps1、tps2基因定量表达研究. 刘建辉,张俊玲,李亮,尚晓冬,谭琦. 2015

[10]低温胁迫下草菇甘油‐3‐磷酸酰基转移酶基因表达变化的研究. 姜威,赵妍,汪虹,冯爱萍,陈明杰. 2014

[11]香菇菌丝后熟转色形成的活性氧作用与自噬特征. 管婉,储婷,鲍大鹏,张建,李福后,唐利华. 2022

[12]农杆菌介导香菇URA3基因RNAi体系构建. 朱秋瑾,李晓慧,刘建雨,姜宁,章炉军,于海龙,尚晓冬,谭琦. 2021

[13]矮牵牛DFR-A基因的克隆与表达分析. 褚云霞,陈海荣,潘俊松,吴爱忠,蔡润,邓姗. 2014

[14]草菇cat1基因序列分析及其低温胁迫下定量表达研究. 赵妍,林锋,姜威,颜素雅,陈明杰. 2015

[15]热激处理对草菇耐冷性的影响及对hsp100基因的诱导. 赵妍,杨焕玲,黄金丽,陈明杰,王晨光,任畇霏,马丹丹. 2017

[16]热激处理对草菇耐冷性的影响及对hsp90基因的诱导. 黄金丽,赵妍,辛苗苗,宋晓霞,陈明杰. 2017

[17]香菇疏水蛋白hyd1基因高温胁迫下表达与生物信息学分析. 辛苗苗,赵妍,黄金丽,宋春艳,陈明杰. 2016

[18]草菇热激蛋白60基因(Vvhsp60)生物信息学分析及低温下的表达. 陈明杰,杨焕玲,余昌霞,姜雅,姜建新,杨华平,赵妍. 2022

[19]不同启动子调控外源基因在斑玉蕈中的表达分析. 杜莎莎,鲍大鹏,马丽娟,李晓玲,尚俊军. 2021

[20]低温胁迫对草菇菌丝体糖原磷酸化酶基因表达的影响. 赵妍,汪虹,李正鹏,禄连静,陈明杰. 2014

作者其他论文 更多>>