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黄精转录组SSR分子标记开发及种质遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 苏海兰 1 ; 江保东 2 ; 朱雁鸣 1 ; 郑梅霞 1 ; 陈宏 1 ; 丁明月 3 ; 牛雨晴 1 ; 朱育菁 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所/福建省种质资源中心

2.井冈山市长坪林场

3.福建农林大学园艺学院

关键词: 黄精;SSR;分子标记;种质资源;遗传多样性

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2024 年 40 卷 026 期

页码: 30-37

收录情况: CSCD

摘要: 为丰富可用于黄精属鉴定的SSR分子标记,开发可用于黄精属(Polygonatum sp.)种质资源鉴定与遗传多样性分析的简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记,为药材黄精正品和伪品的鉴定及遗传多样性分析提供基础.通过对3种黄精属植物进行转录组测序,从60836967个Unigenes鉴定出19630个包含1~6个碱基重复类型的SSR位点,设计和筛选获得了 9对SSR有效性引物,并对来源于5个省份共计31份种质资源进行鉴定与遗传多样性分析.9对SSR引物不仅能够将长梗黄精与其他3种药材黄精划分开,还能够较好地区分不同基源黄精(滇黄精、黄精、多花黄精),并且31份资源遗传相似系数范围为0.0769~0.75.此外,构建了 31份黄精属种质资源的DNA指纹图谱数据库,开发了相对应的指纹图谱.本研究结果为黄精属种质资源的分类鉴定、遗传多样性分析和品种选育提供了可用的分子标记以及参考依据.

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