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花鲈源海分枝杆菌的分离、基因组测序及比较基因组学研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张德锋 1 ; 潘磊 2 ; 可小丽 2 ; 刘志刚 2 ; 潘厚军 2 ; 石存斌 2 ; 卢迈新 3 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室农业部渔用药物创制重点实验室;湖北大学资源环境学院;区域开发与环境响应湖北省重点实验室

2.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室农业部渔用药物创制重点实验室;湖北大学资源环境学院;区域开发与环境响应湖北省重点实验室

3.;中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室农业部渔用药物创制重点实验室;湖北大学资源环境学院;区域开发与环境响应湖北省重点实验室;

关键词： 花鲈;海分枝杆菌;比较基因组学;系统发育树

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 1462-1467

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2015年,广州某养殖场的花鲈(Lateolabrax japonicus)发生细菌性病害,患病花鲈肝脏、脾脏和肾脏有典型的结节症状,病理组织分析表明,肝脏、脾脏和肾脏等器官组织中有大量肉芽肿,而且组织中分布大量抗酸的杆状细菌。从6尾患病花鲈内脏中分离到6株形态相似的菌落,然后对其中一株病原菌HL1506菌株进行基因组测序,分析结果表明该病原菌为海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)。HL1506菌株的基因组大小为6.34 Mb,GC含量为65.68%,编码5 406个基因,具有T1SS分泌系统和T3SS分泌系统。比较基因组学研究表明,HL1506菌株与参考菌株M、MB2、E11和Europe基因组相比,有3 948个共有基因,而该菌株的特有基因为242个。根据共有基因构建系统发育树,结果表明HL1506菌株与人源海分枝杆菌M株和鱼源海分枝杆菌MB2株聚为一枝,这表明它们之间的亲缘关系较近,同时也表明HL1506菌株有感染人的潜在可能。综上,患病花鲈为海分枝杆菌感染,并且有典型的结节症状。海分枝杆菌HL1506基因组与人源菌株有较高的相似性,这表明该菌株对人的健康有潜在的威胁。

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