文献类型： 中文期刊
作者： 王博 1 ; 田园园 1 ; 孙成飞 1 ; 董浚键 1 ; 叶星 1 ;
作者机构： 1.农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室中国水产科学研究院珠江水产研究所;上海海洋大学水产与生命技术学院
关键词： 翘嘴鳜;生长;差异microRNA;肌肉;深度测序技术
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2017 年 02 期
页码： 603-613
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： MicroRNAs(mi RNAs)是一类内源性、长度约22 nt的非编码小RNA,通过转录后调控基因的表达水平、参与生物体的生长与发育等多种生理过程。翘嘴鳜是我国淡水经济鱼类,由于长期人工繁殖忽视亲本选育,导致鳜种质退化,出现生长速度及抗病力下降等问题。本研究中,我们以生长存在显著差异的慢长组和快长组翘嘴鳜肌肉为材料,通过HiSeq 2000深度测序技术和生物信息学分析miRNA转录组,鉴定出433个已知miRNAs并分析miRNAs种子编辑情况。Expdiff方法结合qPCR验证试验,证实了4个表达显著差异的mi RNAs:miR-122、miR-192、miR-451、let-7j-5p。对差异miRNAs进行靶基因预测并通过KEGG Pathway显著性富集分析,发现差异miRNA参与生长、发育、代谢、信号转导等途径,其中Wnt信号通路等在肌肉的生长发育过程起重要作用。本研究为进一步开展miRNA-靶基因的交互作用、了解其对鳜鱼生长的调控机制奠定了基础,并可为鳜鱼分子选育种提供候选基因。
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