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五指山猪FUT1基因SNP检测及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 晁哲 1 ; 王峰 1 ; 黄丽丽 1 ; 刘海隆 1 ; 孙瑞萍 1 ; 郑心力 1 ;

作者机构: 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 五指山猪;FUT1基因;多态性;生物信息学分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2015 年 42 卷 11 期

页码: 2915-2920

收录情况: 北大核心

摘要: 为获得五指山猪FUT1基因序列并分析其基因结构,检测FUT1基因中的单核苷酸多态性(SNP)位点在五指山猪群体中的分布情况,本试验利用PCR扩增猪FUT1基因组序列,通过基因测序寻找该基因中的SNP位点,使用PCR-RFLP方法对120头五指山猪进行了FUT1基因型检测,并运用生物信息学方法对FUT1基因序列进行分析。在猪FUT1基因组中共发现两个单碱基突变,分别位于编码区(A+307G)和3′非翻译区(A+1 856C);在FUT1基因A+307G突变位点上,五指山猪均为GG基因型;此外,FUT1基因启动子区域和第2外显子处存在CpG岛。本研究成功获得五指山猪FUT1基因序列信息,为下一步五指山猪FUT1基因的功能研究奠定基础。

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