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鸭圆环病毒PT07基因组序列测定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: 施少华 1 ; 傅光华 1 ; 程龙飞 1 ; 陈红梅 1 ; 万春和 1 ; 陈珍 1 ; 彭春香 1 ; 林芳 1 ; 黄瑜 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 鸭圆环病毒;基因组;序列分析

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2010 年 32 卷 03 期

页码: 235-237

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究采用PCR方法从临床健康的番鸭法氏囊组织中分段扩增获得鸭圆环病毒(DuCV)PT07全长基因组,将扩增片段分别克隆,获得重组质粒,测序结果表明,DuCV基因组全长为1988nt。经基因组结构分析发现,DuCVPT07的基因组有3个开放阅读框(ORF),其中V1/rep和C1/cap是2个主要的ORF,分别编码Rep蛋白和Cap蛋白;在V1/rep和C1/cap的5'起始端之间存在与启动滚环复制有关的1个茎环结构和1个正向重复序列。遗传进化分析发现,DuCV可分为2个群,PT07与TC1/2002~TC4/2002和FJ0604同处一个进化分支,而与Ger、33753-52和MH25关系较远。

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