文献类型： 中文期刊
作者： 林江波 1 ; 王伟英 1 ; 邹晖 1 ; 戴艺民 1 ;
作者机构： 1.福建省农业科学院亚热带农业研究所
关键词： 铁皮石斛;鲨烯单加氧酶;生物信息学分析;荧光定量PCR
期刊名称： 福建农业学报
ISSN： 1008-0384
年卷期： 2020 年 005 期
页码： 495-502
收录情况： CSCD
摘要： [目的]克隆铁皮石斛(Dendrobium officinale)甾醇类化合物合成关键酶鲨烯单加氧酶(Squalene Monooxygenase,SQE)基因,并对其进行生物信息学分析和不同营养生长期茎和叶中的表达模式分析.[方法]根据铁皮石斛转录组测序获得带5'末端的SQE基因片段,设计DoSQE1与DoSQE2基因的3'RACE引物,克隆全长cDNA,利用生物信息学分析软件对DoSQE1与DoSQE2基因及其编码蛋白序列进行分析.运用实时荧光定量PCR检测DoSQE1与DoSQE2基因在铁皮石斛营养生长期的8月、10月、12月茎和叶中的表达模式.[结果]DoSQE1基因cDNA序列全长1 796 bp(GenBank登录号MT160182),含有1个1 554 bp的ORF,编码517个氨基酸;DoSQE2基因cDNA序列全长1 963 bp(GenBank登录号MT160183),含有1个1 578 bp的ORF,编码525个氨基酸.DoSQE1具有2个跨膜区,分别在4~22 aa和55~72 aa;DoSQE2只有在5~23 aa的1个跨膜区.DoSQE1蛋白在204~476aa、DoSQE2蛋白在211~484 aa处含有鲨烯环氧酶结构域.系统进化分析表明,DoSQE1与姬蝴蝶兰SQE(XP020599860.1)的亲缘关系最近,DoSQE2与姬蝴蝶兰SQE(XP020579136.1)的亲缘关系最近.qRT-PCR检测结果表明,茎和叶中都能检测到2个基因的表达,叶的表达量显著高于茎.DoSQE1基因在8月份表达量最高,DoSQE2基因在10月份表达量最高.[结论]本研究克隆得到DoSQE1和DoSQE2基因,发现DoSQE1和DoSQE2基因的表达模式存在差异,该结果为进一步研究铁皮石斛甾醇类化合物生物合成机理及代谢调控奠定基础.
- 相关文献
[1]铁皮石斛DoSMT2基因的克隆与表达分析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2020
[2]变异型猪繁殖与呼吸综合征病毒TaqMan荧光定量RT-PCR方法的建立与初步应用. 周伦江,王隆柏,方桂友,魏宏,车勇良,陈如敬. 2010
[3]荧光定量PCR技术及在动物疫病检测中的应用. 王隆柏,周伦江,庄向生,魏宏,车勇良,陈如敬. 2010
[4]铁皮石斛人工栽培技术. 邹晖,林江波,李海明,王伟英. 2015
[5]基于转录组测序的铁皮石斛植物甾醇生物合成相关基因分析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2019
[6]GC-MS法比较分析铁皮石斛原球茎和花的挥发性成分. 邹晖,王伟英,戴艺民,林江波. 2019
[7]干旱胁迫下内生真菌对铁皮石斛抗旱性的影响. 邹晖,林江波,戴艺民,王伟英. 2020
[8]闽西宁化2个铁皮石斛品系离体培养条件的优化. 潘红,张静,赖呈纯,黄贤贵,王琦,高慧颖,赖钟雄. 2019
[9]瘤菌根菌对铁皮石斛生长和营养成分的影响. 王伟英,邹晖,戴艺民,林江波. 2021
[10]福建铁皮石斛的组培快繁体系的研究. 蔡宣梅. 2020
[11]一株铁皮石斛内生真菌的鉴定及对株型的影响. 王伟英,邱珊莲,邹晖,戴艺民,林江波. 2019
[12]瘤菌根菌对铁皮石斛根系形态的影响及其共生关系的研究. 王伟英,邹晖,戴艺民,林江波. 2020
[13]基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析. 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2019
[14]铁皮石斛DoLIS基因克隆与茉莉酸甲酯诱导表达分析. 林江波,邹晖,王伟英,戴艺民. 2020
[15]微波消解-电感耦合等离子体质谱法测定铁皮石斛茎和花中多种矿质元素. 黄彪,何伟,刘文静,王红梅,李巍,吴建衍. 2020
[16]铁皮石斛促生内生真菌的功能研究进展. 王伟英,李海明,邹晖,戴艺民,林江波. 2016
[17]铁皮石斛人工栽培技术. 邹晖,林江波,李海明,王伟英. 2016
[18]铁皮石斛白绢病菌的分离鉴定与抑菌药剂筛选. 李海明,林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 2015
[19]铁皮石斛人工栽培技术. 邹晖,林江波,李海明,王伟英. 2016
[20]铁皮石斛茎段原球茎的诱导、分化与植株再生. 林江波,王伟英,李海明,吴水金,邹晖,李跃森,戴艺民. 2016
作者其他论文 更多>>
-
金线莲ArCRC基因的克隆、亚细胞定位和表达分析
作者：林江波;邹晖;黄惠明;李和平;戴艺民
关键词：金线莲;ArCRC基因;转录因子;基因克隆;亚细胞定位;基因表达分析
-
金线莲ArLBD1基因克隆、亚细胞定位及表达分析
作者：林江波;黄惠明;邹晖;李和平;戴艺民
关键词：金线莲;ArLBD1;亚细胞定位;基因克隆;原核表达
-
福建本地益智不同组织挥发油成分的GC-MS分析
作者：李和平;张树河;林江波;戴艺民
关键词：益智;挥发性成分;GC-MS;主成分分析
-
基于主成分分析的金线莲耐热性综合评价
作者：张树河;邹晖;黄惠明;李和平;林江波;戴艺民
关键词：高温驯化;金线莲;生理指标;营养成分
-
香蕉挥发性风味及其影响因素研究进展
作者：张帅;洪佳敏;林宝妹;李海明;吴水金;戴艺民
关键词：香蕉;挥发性风味物质;栽培;贮藏;加工
-
福建6个香牙蕉品种(品系)后熟过程中挥发性风味成分的变化
作者：张帅;吴水金;林宝妹;李海明;吴妙鸿;戴艺民
关键词：香牙蕉;后熟;挥发性风味成分;主成分分析;相对气味活度值
-
米根霉菌纤维素酶活性及其对农田废弃物的降解效果
作者：王伟英;柯叶鑫;李鸿浩;肖顺;王宗华
关键词：米根霉;农业废弃物;纤维素酶;酶活力;发酵
