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粗山羊草CCT基因家族进化及节律表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李晓华 1 ; 丁明亮 2 ; 乔玲 3 ; 李刘军 1 ; 杨堤贻 1 ; 赵佳佳 3 ; 曹勇 3 ; 郑军 ; 杨三维 3 ;

作者机构: 1.山西大学生物工程学院

2.云南省农业科学院粮食作物研究所

3.山西省农业科学院小麦研究所

关键词: 粗山羊草;CCT基因家族;正选择效应;生物钟效应

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2017 年 18 卷 06 期

页码: 1151-1158

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: CCT家族基因广泛参与植物花期的调控过程,粗山羊草(Aegilops tauschii Coss.)作为小麦D基因组供体,给小麦带来新的花期及适应性相关基因。研究粗山羊草CCT家族基因不仅可为小麦进化、驯化和演变规律提供参考,还有助于认识粗山羊草作为杂草的生态适应性。粗山羊草基因组中26个CCT基因进化分析后发现Group A、Group C、GroupH和Group G中的13个Aet CCT成员出现了快速进化;Group A中有42.1%的位点存在正选择效应,表明快速进化提高了粗山羊草的适应性。基因结构分析表明CCT结构域在Aet CCT家族中保守性很高,但不同基因内含子和外显子的排布差异较大,特异Motif可能是不同亚家族基因间功能差异的重要原因。Aet CCT4、Aet CCT7、Aet CCT8、Aet CCT11、Aet CCT12、Aet CCT16、Aet CCT17、Aet CCT19、Aet CCT21和Aet CCT22的表达具有明显的"生物钟效应",呈现出24 h的节律性表达,且基本都处于快速进化的Group A、Group C、GroupH和Group I。研究结果表明,这些成员可能参与花期调控等生长发育过程,在粗山羊草的适应性形成过程中发挥了作用。

  • 相关文献

[1]粗山羊草CCT家族基因序列分析及激素响应. 郑军,乔玲,赵佳佳,乔麟轶,张世昌,常建忠,汤才国,杨三维. 2017

[2]粗山羊草高分子量谷蛋白亚基分析. 闫贵云,刘少翔,孙玉,孙善澄. 2008

[3]粗山羊草全基因组Aux/IAA基因家族的分离、染色体定位及序列分析. 乔麟轶,李欣,畅志坚,张晓军,詹海仙,郭慧娟,李建波,常建忠,郑军. 2014

[4]人工合成冬性六倍体小麦的研究. 闫贵云,孙玉,左静静,牛瑜琦,冯瑞云,霍利光,刘少翔. 2016

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