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香蕉中Maasr1基因的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵宏亮 1 ; 冯仁军 1 ; 苏伟 1 ; 徐碧玉 1 ; 金志强 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院生物技术研究所热带作物生物技术国家重点实验室

关键词： Maasr1基因;生物信息学;结构与功能;预测

期刊名称： 生物技术通讯

ISSN： 1009-0002

年卷期： 2006 年 17 卷 03 期

页码： 336-340

摘要： 目的:利用生物信息学方法对香蕉中Maasr1基因的理化性质、结构与功能进行预测,为其基因功能的研究提供线索,为下一步的实验策略提供参考。方法:用Protparam分析Maasr1编码蛋白的氨基酸序列组成、相对分子质量、等电点等理化性质;用InterProScan分析蛋白质结构域;用Scanprosite寻找Motif;用Predictprotein预测二级结构、疏水性;用Psort进行亚细胞定位;用ClustalW进行多序列比对;用Protfun分析蛋白质功能。结果:通过因特网数据库及生物信息学分析工具进行初步分析表明,Maasr1基因编码的蛋白是一种相对分子质量为16263.8、等电点为5.99的不稳定蛋白,富含Glu、Ala、His、Lys;二级结构主要是α螺旋,具有多种蛋白激酶磷酸化位点和1个豆蔻酰化位点,并具有很高的亲水性,定位于细胞核和细胞质。结论:Maasr1基因可能在植物的糖代谢、生长衰老、果实发育及非生物胁迫过程中起重要作用。

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