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水稻基因插入/缺失多态性分析及模拟遗传图谱构建

文献类型： 中文期刊

作者： 孙玥 1 ; 孙林静 2 ; 杨勇 2 ; 苏京平 2 ; 王胜军 2 ; 刘学军 2 ; 闫双勇 3 ;

作者机构： 1.天津市农作物研究所杂交粳稻研究中心

2.;天津市农作物研究所杂交粳稻研究中心

3.;天津市农作物研究所杂交粳稻研究中心;

关键词： 水稻;插入/缺失多态性;模拟遗传图谱

期刊名称： 宜宾学院学报

ISSN： 1671-5365

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 110-115

摘要： 为构建水稻基因组模拟遗传图谱、开发基于基因的分子标记利用籼粳间序列多态性数据,在SQL数据库中查询获取基于基因的InDel标记.共获得12 649个水稻非转座子编码基因的22 818个InDel位点,InDel大小在6 bp到85 bp之间,非常适合于共显性PCR标记的开发,同时发现水稻染色体臂及大多数着丝区序列位置和遗传图距存在线性相关,以此构建了包含高密度基于基因的InDel标记的模拟遗传图谱,可为水稻的分子育种和遗传作图提供理论和应用参考.

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