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番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 万红建 1 ; 俞锞 1 ; 袁伟 1 ; 刘云飞 1 ; 叶青静 1 ; 王荣青 1 ; 阮美颖 1 ; 姚祝平 1 ; 杨悦俭 1 ;

作者机构： 1.浙江农业科学院蔬菜研究所

关键词： 番茄;WRKY转录因子;生物信息学;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2013 年 11 卷 01 期

页码： 98-106

收录情况： CSCD

摘要： WRKY蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,对植物的生长发育具有重要调控作用。本研究利用番茄全基因组测序结果鉴定了WRKY基因,分析了其系统发育关系,内含子-外显子结构,染色体上的分布及其表达方式。研究表明:番茄中存在81个WRKY转录因子,分为三类(Ⅰ,Ⅱ和Ⅲ),第Ⅰ和Ⅱ类分别细分为2和5个亚类,这些基因不均匀分布在番茄的11条染色体上;基因结构分析表明番茄WRKY转录因子进化过程中可能发生内含子的缺失/获得事件;不同芯片表达分析表明WRKY基因不仅参与了番茄根、子叶和真叶等不同组织类型的生长发育,而且还参与了一些生物胁迫(盐)和非生物胁迫(真菌激活子)的反应。

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