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上海郊区牛病毒性腹泻病毒(BVDV)基因型分析

文献类型: 中文期刊

作者: 谢春芳 1 ; 于瑞嵩 2 ; 董世娟 2 ; 陈冰清 2 ; 冯蒙 2 ; 缪德年 2 ; 李震 3 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所;上海市农业遗传育种重点实验室动物遗传工程研究室;南京农业大学动物医学院

2.;上海市农业科学院畜牧兽医研究所;上海市农业遗传育种重点实验室动物遗传工程研究室;南京农业大学动物医学院

3.;上海市农业科学院畜牧兽医研究所;上海市农业遗传育种重点实验室动物遗传工程研究室;南京农业大学动物医学院;

关键词: 牛病毒性腹泻病毒;基因型;同源性;重组分析

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2017 年 03 期

页码: 119-123

收录情况: CSCD

摘要: 采用RT-PCR方法对2014年在上海郊区某奶牛场分离得到的牛病毒性腹泻病毒(BVDV SHYB)进行基因组5'UTR、Npro和E2基因扩增,并对PCR产物进行克隆、测序和BLAST比对分析,构建系统进化树和进行SimPlot重组分析。结果表明:2014年上海郊区奶牛场感染的BVDV 5'UTR保守序列与猪源性BVDV-1m亚型的ZM-95病毒株高度同源,属BVDV-1m基因亚型,命名为BVDV-1 SHYB;紧接着BVDV-1 SHYB病毒株5'UTR序列后面的Npro基因与BVDV-1b亚型病毒株同源性高,在5'UTR基因的3'端与Npro基因连接处有基因重组位点。

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