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猪细环病毒1b型ORF3基因克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡崇伟 1 ; 陈如敬 2 ; 陈秋勇 1 ; 林群群 1 ; 陈鹏强 1 ; 修金生 1 ;

作者机构: 1.福建农林大学动物科学学院

2.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 猪细环病毒1b型;ORF3基因;序列分析

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2014 年 41 卷 08 期

页码: 76-80

收录情况: 北大核心

摘要: 为明确福建省猪细环病毒(porcine torque teno sus virus,PTTSuV)1b型(PTTSuV-1b)ORF3基因的遗传进化特征,本研究根据GenBank中登录的PTTSuV-1b基因组特征设计特异性引物,对福建省某猪场患有仔猪断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)的猪血清进行PTTSuV-1b分段扩增,并分别对PCR扩增产物进行胶回收后克隆测序,将测序结果经BLAST分析后进行序列拼接。试验结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的PTTSuV-1bORF3蛋白,全长为600bp,编码有199个氨基酸。将获得的PTTSuV-1b型福建株与GenBank中PTTSuV-1b型的ORF3基因进行比对分析,其与FJ/China/2010/TTV2/2株核苷酸同源性最高,为99.7%,与西班牙PTTSuV-1b分离株TTV2_G43核苷酸同源性为97.3%,与SC株核苷酸同源性稍低,但也达94.0%;而与猪细环病毒K2型德国家猪分离株472142株核苷酸同源性仅为60.7%,与猪细环病毒1a型西班牙分离株PTTV1_1914株核苷酸同源性仅为46.8%。从遗传进化关系上看,PTTSuV-1bORF3基因在遗传进化上呈2个大的遗传进化分支(分支Ⅰ和分支Ⅱ),本研究分离株处于分支Ⅰ。

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