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文昌锥SRAP-PCR体系优化及有效引物筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 孙秀秀 1 ; 陈加利 1 ; 杨立荣 1 ; 云勇 1 ; 戚华沙 1 ; 郑道君 1 ;

作者机构： 1.海南省农业科学院热带园艺研究所海南省农业科学院海南省热带特种经济植物种质资源创新利用重点实验室

关键词： 文昌锥;SRAP;反应体系;引物

期刊名称： 西南林业大学学报(自然科学)

ISSN：

年卷期： 2021 年 001 期

页码：

摘要： 通过单因素试验和正交试验相结合,分析DNA、引物、dNTPs、Taq DNA聚合酶4种因素对文昌锥SRAP-PCR扩增结果的影响,优化建立文昌锥SRAP-PCR体系.结果表明:文昌锥基因组DNA浓度和dNTPs浓度过低或过高均扩增不出产物,而引物浓度和Taq酶用量的增加能提高扩增效率.在适宜浓度范围内,各个因素对文昌锥SRAP-PCR扩增影响大小依次为:引物=dNTPs>Taq酶>DNA;最优反应体系为:总体系为20μL时,DNA 20 ng,引物0.6μmol/L,dNTPs0.15 mmol/L和Taq酶4 U.经验证,该体系获得的扩增产物清晰、稳定;筛选获得45对有效性引物组合多态性好,可应用于SRAP分子标记技术在文昌锥资源研究.

  • 相关文献

[1]海南特有极小种群植物文昌锥的SCoT-PCR体系建立及有效引物评价. 杨立荣,孙秀秀,陈加利,云勇,陈宣,郑道君. 2020

[2]海南油茶SCoT反应体系建立与多态性引物筛选. 戚华沙,谢秋霞,林基忠,陈加利,王春梅,郑道君,王健. 2023

[3]利用SRAP标记研究海南野生稻的遗传多样性与遗传分化. 齐兰,王效宁,张吉贞,唐清杰,孟卫东,严小微. 2013

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