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乌鬃鹅α干扰素基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈红梅 1 ; 万春和 1 ; 程龙飞 1 ; 傅光华 1 ; 施少华 1 ; 傅秋玲 1 ; 黄瑜 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 乌鬃鹅;α干扰素基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国动物传染病学报

ISSN： 1674-6422

年卷期： 2013 年 06 期

页码： 68-72

摘要： 采用RT-PCR方法从乌鬃鹅肝脏中扩增α干扰素(Interferon,IFN-α)基因片段,将扩增片段克隆到pMD18-T载体上,经PCR和双酶切鉴定为阳性后进行序列测定,并用生物信息学软件Lasergene v7.1 DNAStar和在线分析方法对IFN-α基因的核苷酸序列及其氨基酸序列进行了生物信息学分析,同时与GenBank中登录的鸡、鸭和鹅IFN-α基因核苷酸序列进行同源性比较分析。结果表明,所扩增的IFN-α基因编码完整的开放阅读框,基因长度为576 bp,与鸡、鸭与鹅IFN-α基因核苷酸序列同源性在72.0%～99.7%,遗传进化树显示鸡、鸭、鹅IFN-α因在遗传进化上各处一支。乌鬃鹅IFN-α基因的克隆及生物信息学分析为进一步研究鹅干扰素抗病毒的作用机理奠定基础。

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